Champs de données Symbiota
Cette page fournit des définitions de champs de données visant à favoriser l'interopérabilité des données au sein des portails Symbiota.
- Les champs listés ici diffèrent de ceux qui apparaissent dans les outils de téléversement de données. Pour obtenir des informations spécifiques aux champs utilisés lors du téléversement, veuillez consulter la documentation sur les champs d'importation de données.
- Si vous souhaitez savoir comment importer des données dans votre portail, vous trouverez ces informations ici. (Ces conseils de téléversement pourraient vous être particulièrement utiles si vous débutez dans l'importation de données vers les portails Symbiota !)
- Le schéma de données Symbiota est étroitement aligné sur la norme de données Darwin Core (DwC). Pour plus de détails, des liens vers les définitions Darwin Core sont fournis pour chaque terme. Apprenez-en davantage sur les termes Darwin Core en consultant les pages suivantes du TDWG : TDWG - Guide de référence rapide Darwin Core, TDWG - Liste des termes Darwin Core
Champs standard
Comme les portails ont la possibilité de personnaliser les noms des champs figurant sur leurs formulaires de saisie, ces noms peuvent différer de la définition du champ de base ou de la manière dont il est mappé vers les outils d'exportation Darwin Core.
Informations sur le collecteur
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| Section « Informations sur le collecteur » du formulaire d'édition des occurrences |
Numéro de catalogue
L'identifiant unique (clé primaire) de la fiche du spécimen. Ce champ doit être utilisé pour stocker le code-barres ou le numéro d'acquisition (herbiers uniquement). L'unicité de ce champ est imposée au sein de chaque collection.
Exemples : WIS-L-0123456 ASUCOB0012345
Voir le terme catalogNumber du Darwin Core.
Valeurs d'identifiants supplémentaires
Tout autre identifiant associé à la fiche d'un spécimen, autre que le numéro de catalogue principal. Ce champ est généralement utilisé pour stocker les anciens numéros de catalogue, les numéros d'acquisition, les identifiants de parcs nationaux, etc. Une étiquette peut être attribuée à ces identifiants pour les distinguer les uns des autres (par ex. ancien n° d'acquisition, n° NPS, etc.). Ces identifiants correspondent le mieux à la définition du terme dwc:otherCatalogNumbers et sont donc inclus dans les exports sous ce champ. De plus amples informations sur ce système sont disponibles sur la page de documentation relative aux numéros de catalogue.
Exemples : TUZI 3082 NPS Acc #: GUIS-M-00126
Voir le terme otherCatalogNumbers du Darwin Core ainsi que l'extension pour les identifiants alternatifs.
Collecteur
Le nom de la personne ayant collecté le spécimen ou effectué l'observation.
Exemples : C.G. Pringle Goodding, L.N. John Wesley Powell `M. Andrew Johnston (ORCID 0000-0002-0166-6985)
Voir le terme recordedBy du Darwin Core
Collecteurs associés
Autres collecteurs présents au moment de la collecte.
Exemples : John R. Reeder, Alan Nelson
Ce champ n'est pas défini par la norme Darwin Core, qui regroupe les collecteurs principaux et secondaires dans le champ recordedBy.
Numéro
Numéro de collecte attribué au spécimen par le collecteur.
Exemples : 1294 12490b 94-132
Voir le terme recordNumber du Darwin Core
Date (début)
La date de collecte du spécimen ou, si une plage de dates est indiquée, le premier jour de cette plage. Bien que les dates puissent être saisies dans le format de votre choix, la valeur sera convertie et stockée au format numérique ISO-8601 (AAAA-MM-JJ). Notez que les mois et les jours inconnus peuvent être saisis sous la forme « 00 ». Par exemple, une collecte datée de « mars 1956 » peut être saisie comme « 1956-03-00 ».
Exemples : 1983-09-15 1983-07-00 1934-00-00
Voir le terme eventDate du Darwin Core.
Date de fin
La dernière date de collecte, dans le cas d'une plage de dates de collecte. Bien que les dates puissent être saisies dans le format de votre choix, la valeur sera convertie et stockée au format numérique ISO-8601 (AAAA-MM-JJ). Notez que les mois et les jours inconnus peuvent être saisis sous la forme « 00 ». Par exemple, une collecte datée de « mars 1956 » peut être saisie comme « 1956-03-00 ».
Exemples : 1983-09-15 1983-07-00 1934-00-00
Voir le terme eventDate du Darwin Core.
Date (telle qu'indiquée)
La date de collecte ou d'observation telle qu'elle figure exactement sur une étiquette ou dans les notes de terrain. Particulièrement utile pour les formats de date non standard ou les plages de dates.
Exemples : Spring 1901 March-April 1952 late Sept. 1909
Voir le terme verbatimEventDate du Darwin Core
Heure de l'événement
L'heure de la collecte ou de l'observation associée à un enregistrement. Ce champ est actuellement un champ de texte ne nécessitant aucun formatage spécifique. Toutefois, il est recommandé d'utiliser une norme telle que l'ISO pour représenter l'heure.
Exemples : 18:00:00.000 2:46 PM
Voir le terme eventTime du Darwin Core
Dernière identification
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| Section « Dernière identification » du formulaire de l'éditeur d'occurrence |
Nom scientifique
Le nom latin du spécimen, sans l'auteur. Il peut s'agir de n'importe quel rang taxonomique, du règne jusqu'à la sous-espèce ou la variété, selon le niveau de l'identification.
Exemples : Pinaceae Pinus Pinus edulis Pinus edulis var. fallax
Voir le terme scientificName du Darwin Core
Lors de la saisie directe du Nom scientifique dans l'éditeur d'occurrence, un menu déroulant peut apparaître pour faciliter la saisie, en s'appuyant sur le thésaurus taxonomique interne de votre portail. Les taxons ne figurant pas dans la liste déroulante peuvent tout de même être saisis et enregistrés.
Auteur
Le nom de la personne ayant nommé le taxon pour la première fois. Ce champ se remplit automatiquement après la saisie du nom scientifique. Si le nom saisi dans le champ « Nom scientifique » figure dans le thésaurus taxonomique, ce champ sera automatiquement renseigné à partir de celui-ci. Les conventions de formatage peuvent varier selon la discipline (par ex. botanique ou zoologie).
Exemples : L. A. Gray (Anderson, 1938)
Voir le terme scientificNameAuthorship
Qualificatif d'identification
L'expression de l'incertitude de l'identificateur concernant son identification. Cette mention figurera sur l'étiquette aux côtés du nom scientifique.
Exemples : cf. aff. ?
Voir le terme identificationQualifier
Famille
La famille à laquelle appartient le taxon indiqué dans le champ « Nom scientifique ». Si le nom saisi dans le champ « Nom scientifique » figure dans le thésaurus taxonomique, ce champ sera automatiquement renseigné à partir de ce dernier.
Exemples : Pinaceae Mephitidae
Voir le terme family du Darwin Core
Identifié par
Le nom de la personne ayant identifié le spécimen. Également appelé « déterminateur ».
Exemples : Leslie R. Landrum
Voir le terme identifiedBy du Darwin Core
Date d'identification
La date à laquelle l'identification a été effectuée. La date peut être saisie sous forme de texte libre et ne nécessite pas de format standard.
Exemples : 1992 May 1992 2 May 1992
Voir le terme dateIdentified du Darwin Core
Références d'identification
La source de référence utilisée pour effectuer l'identification.
Exemples : Nesom, Guy L. 2006. Flora of North America - Asteraceae. vol. 20
Voir le terme identificationReferences du Darwin Core
Remarques sur l'identification
Toute note supplémentaire concernant l'identification du spécimen.
Exemples : pétales roses mais longueur du calice plus caractéristique de S. angustifolium détermination basée sur la taille et la forme des testicules
Voir le terme identificationRemarks du Darwin Core
Remarques sur le taxon
Toute note supplémentaire concernant le nom taxonomique attribué au spécimen lors de son identification. Dans les collections biologiques, ce champ est souvent utilisé pour enregistrer les noms vernaculaires.
Exemples : Taxon probablement plus valide Smalley's wooly aster
Voir le terme taxonRemarks du Darwin Core
Localité
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| Section « Localité » du formulaire de l'éditeur d'occurrences |
Continent
Le nom du continent où le spécimen a été collecté.
Exemples : Amérique du Sud Australie
Voir le terme continent du Darwin Core
Étendue d'eau
Le nom de l'étendue d'eau où le spécimen a été collecté.
Exemples : Océan Pacifique Mer Noire
Voir le terme waterBody du Darwin Core
Groupe d'îles
Le nom du groupe d'îles où le spécimen a été collecté.
Exemples : Îles Hawaï Archipel Alexandre
Voir le terme islandGroup du Darwin Core
Île
Le nom de l'île où le spécimen a été collecté.
Exemples : Cayo Coco Maui
Voir le terme island du Darwin Core
Pays
Le nom du pays où le spécimen a été collecté. Pour faciliter la saisie des données, un menu déroulant s'affiche lors de la frappe, bien qu'il soit toujours possible de saisir des noms ne figurant pas dans la liste.
Exemples : États-Unis Brésil Togo
Voir le terme country du Darwin Core
État/Province
Le nom de l'État ou de la province où le spécimen a été collecté. Pour faciliter la saisie des données, un menu déroulant s'affiche à mesure que vous tapez ; toutefois, il reste possible de saisir des noms ne figurant pas dans la liste.
Exemples : New York Hidalgo
Voir le terme stateProvince du Darwin Core.
Comté
Le nom du comté où le spécimen a été collecté. Pour faciliter la saisie des données, un menu déroulant s'affiche à mesure que vous tapez ; toutefois, il reste possible de saisir des noms ne figurant pas dans la liste. Pour les enregistrements hors États-Unis, indiquez la division géographique située immédiatement en dessous du niveau État/Province.
Exemples : Maricopa Washington
Voir le terme county du Darwin Core.
Lors de la saisie directe des données dans les champs Pays, État/Province et Comté via l'éditeur d'occurrences, un menu déroulant peut apparaître pour faciliter la saisie, en s'appuyant sur le thésaurus géographique interne de votre portail. Il est tout de même possible de saisir et d'enregistrer des valeurs ne figurant pas dans la liste déroulante.
Municipalité
Le nom de la municipalité où le spécimen a été collecté. Pour les spécimens collectés en dehors des États-Unis, indiquez la désignation géographique de quatrième niveau.
Exemples : Paradise Valley
Voir le terme municipality du Darwin Core
Localité
L'emplacement détaillé où le spécimen a été collecté.
Exemples : 9,5 miles au nord-ouest de Sedona, le long de Boynton Pass Rd.
Voir le terme locality du Darwin Core
Identifiant de l'emplacement (Location ID)
Un identifiant pour l'ensemble des informations de localisation (données associées à dcterms:Location). Il peut s'agir d'un identifiant unique global ou d'un identifiant spécifique au jeu de données.
Exemples : https://opencontext.org/subjects/768A875F-E205-4D0B-DE55-BAB7598D0FD1 USNM loc. 2126
Voir le terme locationID du Darwin Core
Remarques sur l'emplacement (Location Remarks)
Commentaires ou notes concernant la localité.
Exemples : Anciennement connu sous le nom de Mt. Evans Localité inaccessible
Voir le terme locationRemarks du Darwin Core
Sécurité
La sélection de l'option « Locality Security applied » (Sécurité de la localité appliquée) dans le menu déroulant masquera les détails de la localité (à un niveau plus précis que celui du comté) aux utilisateurs non autorisés. Cette mesure est généralement prise lorsque l'espèce est rare ou menacée, ou lorsque le lieu de collecte est une propriété privée. Les images et autres médias sont également masqués afin de protéger les détails de la localité qui pourraient être visibles sur l'étiquette. Les utilisateurs connectés au système disposant des autorisations nécessaires pour voir les détails de la localité (par exemple, les gestionnaires de collections) continueront d'avoir accès à toutes les données. La sécurité de la localité sera automatiquement appliquée si le nom de l'espèce figure sur la liste des espèces protégées du portail (accessible via le plan du site). Choisir l'option « Sécurité totale appliquée » (Full Security applied) masquera entièrement l'enregistrement aux utilisateurs publics ne disposant pas d'autorisations d'éditeur ou d'administrateur pour votre collection. À moins que des protections juridiques ne s'appliquent, ce niveau de sécurité n'est généralement PAS recommandé pour la plupart des enregistrements, car il réduit la visibilité de vos collections et soustrait des données précieuses à la recherche et à l'usage public. Laisser le champ de sécurité sur « Sécurité non appliquée » (Security not applied) permet d'appliquer les paramètres par défaut définis par les administrateurs chargés des espèces sensibles ; c'est l'option recommandée pour la plupart des enregistrements. Consultez le guide du gestionnaire de collection (Collection Manager Guide) pour en savoir plus sur le fonctionnement du masquage des données (data redaction) dans les portails Symbiota.
Ce champ n'est pas défini par la norme Darwin Core.
Latitude et longitude
La latitude et la longitude géographiques en degrés décimaux. Les latitudes de l'hémisphère sud et les longitudes de l'hémisphère ouest (par ex. États-Unis) doivent être saisies sous forme de valeurs négatives. Cliquez sur le bouton « Outils » (Tools) pour saisir les coordonnées aux formats degrés, minutes, secondes (DMS) ou UTM. Les degrés décimaux constituent la norme de coordonnées privilégiée, telle que définie par Darwin Core.
Exemples : 34.874022 -111.75774
Voir les termes Darwin Core decimalLatitude et decimalLongitude
Incertitude
La précision des coordonnées de géoréférencement exprimée en mètres (valeur numérique uniquement). Elle correspond au rayon d'un cercle à l'intérieur duquel se trouverait le point réel, s'il était connu. Si les coordonnées sont relevées à l'aide d'un GPS, la précision correspond à la marge d'erreur de l'appareil (généralement autour de 10 m). Pour les spécimens anciens dont les coordonnées ont été notées par le collecteur sans indication de la source (GPS, carte, etc.), on peut généralement supposer une précision de l'ordre de 100 à 200 mètres. Si les informations de localisation sont vagues (par exemple, simplement « Grand Canyon »), les coordonnées doivent correspondre au centroïde de la zone d'incertitude englobant la région plus large où le spécimen a pu être collecté. Si la localité est « Boynton Canyon, Sedona », l'incertitude sera d'environ 1 500 m. Ce champ se remplit automatiquement lors de l'utilisation de GeoLocate pour le géoréférencement.
Exemples : 42000 100
Voir le terme coordinateUncertaintyInMeters du Darwin Core.
Système géodésique (Datum)
Le système géographique utilisé pour déterminer les coordonnées. Ce champ se remplit automatiquement lors de l'utilisation de GeoLocate ou de l'outil de cartographie pour le géoréférencement.
Exemples : NAD27 NAD83 WGS84
Voir le terme geodeticDatum du Darwin Core.
Coordonnées verbatim
Valeurs des coordonnées telles qu'elles figurent sur l'étiquette du spécimen, dans le registre des localités ou dans les notes de terrain, si elles n'ont pas été enregistrées initialement en degrés décimaux. Si vos coordonnées sont exprimées en degrés-minutes-secondes (DMS), en coordonnées UTM (Universal Transverse Mercator) ou selon le système TRS (Township-Range-Section), cliquez sur le bouton « F » pour afficher les outils de formatage. Saisissez les coordonnées figurant sur votre étiquette dans le champ approprié et cliquez sur le bouton « Insérer les valeurs » correspondant. Les valeurs valides aux formats DMS ou UTM seront automatiquement converties en degrés décimaux. Si une valeur a déjà été saisie dans le champ « Verbatim Coordinates » (Coordonnées brutes), vous pouvez cliquer sur les doubles flèches situées à gauche de ce champ pour tenter une conversion automatique au format degrés décimaux. Les coordonnées TRS ne peuvent pas être converties automatiquement dans le formulaire de saisie, mais elles peuvent être transformées en une géoréférence appropriée à l'aide de l'outil GEOLocate. Pour plus d'informations à ce sujet et sur l'utilisation des outils de coordonnées, consultez cette vidéo tutorielle.
Exemples : 34° 13.940' N 112° 2.370' W 12 420944E 4064025N TRS: T40N R32E S29
Voir le terme verbatimCoordinates du Darwin Core.
Élévation en mètres
L'élévation en mètres à laquelle le spécimen a été récolté. Également appelée altitude. Utilisez uniquement le champ de gauche (en laissant le champ de droite vide) lorsqu'il n'y a qu'une seule valeur d'élévation. Utilisez le champ de gauche pour indiquer l'élévation minimale en mètres et le champ de droite pour indiquer l'élévation maximale en mètres.
Exemples : 1400 2000
Voir les termes minimumElevationInMeters et maximumElevationInMeters du Darwin Core.
Élévation brute (Verbatim Elevation)
L'élévation brute (telle qu'indiquée à l'origine) à laquelle le spécimen a été récolté. Ce champ est généralement utilisé pour consigner une mesure d'élévation enregistrée en pieds ou une indication d'incertitude. Lorsque le champ « Élévation en mètres » est laissé vide, la valeur sera automatiquement convertie en mètres. Sélectionnez la double flèche pour remplacer les valeurs en mètres saisies précédemment.
Exemples : 4500ft 4500 feet ca 4500' ca 2000m 4500' +-300'
Voir le terme verbatimElevation du Darwin Core.
Profondeur en mètres
La plage de profondeur sous la surface locale, en mètres. Utilisez le champ de gauche pour indiquer la profondeur minimale en mètres et le champ de droite pour indiquer la profondeur maximale en mètres.
Exemples : 100 1042
Voir les termes minimumDepthInMeters et maximumDepthInMeters du Darwin Core.
Profondeur (telle qu'indiquée)
La description originale (telle qu'indiquée) de la profondeur sous la surface locale à laquelle le spécimen a été récolté.
Exemples : 100ft 100 feet ca 100' ca 30m 100' +-10' 7 fathoms
Voir le terme verbatimDepth du Darwin Core
Géoréférencé par
Le nom (ou nom d'utilisateur) de la personne ayant géoréférencé la fiche du spécimen. Ce champ se remplit automatiquement lors de l'utilisation de GeoLocate pour le géoréférencement.
Exemples : Amanda Gonzales emakings acbarber
Voir le terme georeferencedBy du Darwin Core
Sources de géoréférencement
L'outil ou les outils utilisés pour le géoréférencement, ainsi que toute référence consultée pour géoréférencer la fiche.
Exemples : GeoLocate Google Earth USGS 1:24000 Florence Montana Quad 1967
Voir le terme georeferenceSources du Darwin Core
Remarques sur le géoréférencement
Notes concernant le géoréférencement du spécimen.
Exemples : point placé au centroïde de la ville, rayon d'erreur correspondant à l'étendue des limites de la ville telles qu'observées sur Google Satellite
Voir le terme georeferenceRemarks du Darwin Core
Protocole de géoréférencement
La source des normes utilisées pour le géoréférencement.
Exemples : Georeferencing Quick Guide. Zermoglio et al. 2020 Engelbrecht, I. 2021. https://doi.org/10.3897/biss.5.73572
Voir le terme georeferenceProtocol du Darwin Core
Statut de vérification de la géoréférence
Un statut indiquant si la géoréférence a été examinée ou vérifiée.
Exemples : reviewed (examiné) not reviewed (non examiné) needs verification (nécessite une vérification) verified by collector (vérifié par le collecteur)
Voir le terme georeferenceVerificationStatus
Divers
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| Section « Divers » du formulaire de l'éditeur d'occurrences |
Habitat
Description de l'habitat dans lequel le spécimen a été récolté.
Exemple : Zones humides le long d'un petit ruisseau dans du chaparral forêt de feuillus ; exposition du versant : 154 ; inclinaison de la pente : 2,29 ; ordre du type de sol : Inceptisols
Voir le terme habitat du Darwin Core.
Substrat
Substrat sur lequel le spécimen a été récolté (principalement utilisé pour les lichens, les bryophytes et les spécimens zoologiques).
Exemples : sur basalte tronc de chêne
Le Darwin Core regroupe actuellement cette information dans dwc:habitat.
Taxons associés
Liste des noms d'autres espèces présentes aux côtés du spécimen récolté.
Exemples : Quercus, Arctostaphylos, Ceanothus, Rhus, Eriogonum, Salvia
Voir le terme associatedTaxa du Darwin Core.
Description
Description physique du spécimen au moment de la récolte. Elle inclut souvent des informations susceptibles d'être perdues ou difficiles à observer après les processus de récolte et de conservation. Pour les collections de fossiles : Description contextualisant ce que le matériel fossile catalogué représente physiquement.
Exemples (botanique) : Arbuste de 3 m de haut corolle jaune
Exemples (fossiles) : Les os sont inclus dans le montage composite USNM V 10304 1 moulage en plâtre avec 5 fragments du spécimen original
Ce champ n'est pas pris en charge par le Darwin Core et est concaténé dans occurrenceRemarks lors du téléchargement sous forme d'archive Darwin Core.
Notes
Toute note supplémentaire concernant la présence du spécimen à un endroit et à un moment donnés. Évitez d'utiliser ce champ à moins qu'il n'existe pas de champ de données plus approprié.
Exemples : commun dans cette région ce spécimen a été collecté dans le cadre d'un projet de mémoire de master
Voir le terme occurrenceRemarks du Darwin Core
Propriétés dynamiques (Dynamic Properties)
Une liste de mesures, faits, caractéristiques ou affirmations supplémentaires concernant le spécimen, présentée dans un format permettant une analyse automatisée (par programme) des données, par exemple sous forme de paires clé:valeur séparées par un délimiteur.
Exemples : awnLengthInMeters=0.014, heightInMeters=1.5, relativeHumidity=28, airTemperatureInC=22 totalLength: NA | weight: 25 g
Voir le terme dynamicProperties du Darwin Core
Stade de vie (Life Stage)
L'âge ou le stade de développement de l'organisme au moment de la collecte ou de l'observation (généralement utilisé pour les collections zoologiques).
Exemples : larve juvénile adulte
Voir le terme lifeStage du Darwin Core
Sexe
Le sexe biologique de l'occurrence.
Exemples : femelle mâle gynandromorphe
Voir le terme sex de Darwin Core
Nombre d'individus
Le nombre d'individus représentés par l'occurrence. Pour les collections de fossiles : inclure un descripteur de quantité.
Exemples : 2 15
Exemples (fossiles uniquement) : 2 élément(s) estimation de 200
Voir le terme individualCount de Darwin Core
Protocole d'échantillonnage
Les noms et références des méthodes utilisées pour collecter ou échantillonner une occurrence.
Exemples : piège lumineux UV filet japonais Takats et al. 2001. Guidelines for Nocturnal Owl Monitoring in North America. Beaverhill Bird Observatory and Bird Studies Canada, Edmonton, Alberta. 32 pp., http://www.bsc-eoc.org/download/Owl.pdf
Voir le terme samplingProtocol de Darwin Core
Préparations
Méthode de préparation ou de conservation d'un spécimen. Bien qu'il n'existe actuellement aucun vocabulaire contrôlé universel pour ce champ, un exemple pratique pour les collections biologiques est disponible ici.
Exemples : in ethanol study skin pressed and dried part-counterpart
Voir le terme preparations du Darwin Core.
Phénologie (État reproducteur)
Le stade de reproduction dans lequel se trouve le spécimen.
Exemples : flower fruit sterile
Voir le terme reproductiveCondition du Darwin Core.
Comportement
Le comportement manifesté par l'organisme ou l'occurrence au moment de la collecte ou de l'observation.
Exemples : flying sitting on eggs
Voir le terme behavior du Darwin Core.
Vitalité
Indication précisant si l'organisme était vivant ou mort au moment de la collecte ou de l'observation.
Exemples : live (vivant), dead (mort)
Voir le terme vitality du Darwin Core
Mode d'établissement
État ou nature de l'établissement de l'individu au moment de la collecte.
Exemples : cultivated (cultivé), invasive (envahissant), native (indigène)
Voir le terme establishmentMeans du Darwin Core
Case à cocher « Cultivé »
Cochez cette case si l'organisme a été établi avec l'aide de l'homme au moment de la collecte. Ce champ booléen (vrai/faux) permet de filtrer les espèces non indigènes ou naturalisées.
Ce champ n'est pas actuellement pris en charge par le Darwin Core et n'est donc pas inclus dans les exportations au format Darwin Core.
Curation
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| Section « Curation » du formulaire de l'éditeur d'occurrences |
Statut du type
Désignation du type d'un spécimen, qu'il s'agisse d'un spécimen porte-nom ou d'un élément d'une série type.
Exemples : holotype, isotype, paratype
Voir le terme typeStatus du Darwin Core
Disposition
Emplacement ou statut du spécimen physique par rapport à une collection.
Exemples : missing (manquant), on loan (en prêt), in collection (en collection), stored under genus "Mimulus" (stocké sous le genre « Mimulus »)
Voir le terme disposition du Darwin Core
Identifiant d'occurrence (remplacement)
Identifiant unique mondial (GUID) du spécimen. Cette valeur doit être stable et identifier le spécimen de manière unique par rapport à tous les autres spécimens dans le monde. Si votre collection est configurée pour que les occurrenceID/GUID soient générés par le portail (il s'agit du paramètre recommandé pour toutes les collections gérées en temps réel), le champ occurrenceID apparaîtra en gris et ne sera pas modifiable. Pour afficher la valeur complète de l'occurrenceID associée à votre spécimen, vous pouvez cliquer sur le lien « Public Display » (Affichage public) situé en haut de la page.
Exemples : 000866d2-c177-4648-a200-ead4007051b9 urn:catalog:UWBM:Bird:89776
Voir le terme occurrenceid du Darwin Core.
Numéro de terrain
Un identifiant attribué à l'événement de collecte sur le terrain. Ce numéro sert souvent de lien entre l'événement indiqué dans les notes de terrain et la fiche du spécimen.
Exemples : 2024-04-05-00045 JOSHUATREE_35 2025AH0718-01
Voir le terme fieldnumber du Darwin Core
Langue
La langue des informations figurant sur l'étiquette ou dans la fiche.
Exemples : en es pt fr
Voir le terme language du Darwin Core
Projet d'étiquette
Une valeur utilisée pour regrouper des fiches provenant d'un projet ou d'une catégorie spécifique à des fins internes. Une fois une valeur saisie dans ce champ, toutes les fiches partageant cette même valeur peuvent être imprimées simultanément à l'aide des outils d'impression d'étiquettes par lots
Exemples : Plants of Sedona 2012 PCC TCN 2018
Ce champ ne correspond pas à un terme du Darwin Core et est exclu des exportations d'archives Darwin Core.
Nombre de doubles
Le nombre de spécimens botaniques en double créés. Cette valeur détermine le nombre d'étiquettes à imprimer pour le spécimen.
Exemples : 10 2
Voir le terme duplicatequantity du Darwin Core
Code de l'institution (substitution)
L'acronyme de l'institution responsable de cette occurrence. Ne saisissez une valeur que si elle diffère de celle indiquée dans les métadonnées de la collection sur le portail.
Exemples : NMNH FLMNH
Voir le terme institutionCode du Darwin Core
Code de la collection (substitution)
L'acronyme de la collection responsable de cette occurrence. Ne saisissez une valeur que si elle diffère de celle indiquée dans les métadonnées de la collection sur le portail.
Exemples : Herps F
Voir le terme collectionCode du Darwin Core.
Code du propriétaire (prioritaire)
Le nom (ou l'acronyme) utilisé par l'institution propriétaire de l'objet ou des informations faisant l'objet de la notice. Ne saisissez une valeur que si elle diffère de celle indiquée dans les métadonnées de la collection sur le portail.
Exemples : NPS BLM NMNH
Voir le terme ownerInstitutionCode du Darwin Core.
Emplacement de stockage
L'emplacement physique permanent de stockage du matériel catalogué au sein de l'espace de la collection.
Exemples : Freezer 3 Oversize Storage Cab011 | Dwr002 Cabinet: 1 | Tray 4 Miocene Cabinet
Nature de la notice (Basis of Record)
Le type de notice attribué au spécimen. Pour les collections de spécimens conservés physiquement, la valeur par défaut de ce champ est PreservedSpecimen ou FossilSpecimen, selon la configuration de votre collection ; pour les projets d'observation, la valeur par défaut est HumanObservation.
Exemples : PreservedSpecimen LivingSpecimen HumanObservation MaterialCitation FossilSpecimen
Voir le terme basisOfRecord du Darwin Core.
Statut de traitement
Le statut de la notice numérique. Ce champ vise à faciliter la gestion et la révision internes des données propres à la collection. Les valeurs utilisées dépendent du flux de travail spécifique à chaque institution.
Exemples : Reviewed Pending Review Stage 1
Ce champ ne correspond à aucun terme du Darwin Core et est exclu des exportations au format Darwin Core Archive.
Généralisations des données
Notes internes associées à la notice d'occurrence. Les données saisies dans ce champ ne sont pas visibles sur le formulaire de recherche public, mais elles peuvent être consultées dans un fichier Darwin Core Archive téléchargé.
Exemples : données vérifiées le 2025-05-12 problèmes potentiels de géoréférencement, à vérifier par le conservateur
Voir le terme dataGeneralizations du Darwin Core.
Champs spécifiques aux modules
Les champs de données suivants correspondent à des modules qui peuvent ne pas être disponibles sur tous les portails Symbiota. L'activation de certains modules peut nécessiter une concertation au sein de la communauté. Contactez le gestionnaire de votre portail pour plus d'informations.
Échantillon de matériel
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| Onglet « Échantillon de matériel » dans le formulaire d'édition d'occurrence |
Les vocabulaires contrôlés pour les champs de données « Échantillon de matériel » sont gérés au niveau de chaque portail ; les exemples suggérés ci-dessous sont issus des vocabulaires utilisés pour la biothèque NEON. Ces vocabulaires varient d'un portail à l'autre et toute modification peut nécessiter l'avis de la communauté. Contactez l'administrateur de votre portail pour plus d'informations.
Type d'échantillon
Le type d'échantillon, souvent de nature anatomique. Un vocabulaire contrôlé est imposé selon le portail.
Exemples : crâne foie tractus gastro-intestinal organes génitaux ADN
Voir le terme materialSampleType de l'extension GGBN pour les échantillons de matériel.
Numéro de catalogue / Code-barres
Un identifiant unique pour l'échantillon de matériel, analogue au champ catalogNumber pour les occurrences de spécimens.
Exemples : D00000044967
Voir le terme catalogNumber du Darwin Core.
Identifiant de l'échantillon de matériel (GUID)
Un identifiant unique à l'échelle mondiale pour l'échantillon de matériel. En l'absence d'un identifiant unique mondial persistant, il convient d'en construire un en combinant des identifiants présents dans l'enregistrement afin de garantir son unicité mondiale.
Exemple : 06809dc5-f143-459a-be1a-6f03e63fc083
État de l'échantillon
L'état physique de l'échantillon. L'utilisation d'un vocabulaire contrôlé est recommandée mais non obligatoire.
Exemples : très mauvais mauvais médiocre bon inconnu
Voir le terme quality de l'extension GGBN pour les échantillons de matériel.
Disposition
L'état actuel d'un échantillon par rapport à la collection dont il fait partie. Vocabulaire contrôlé imposé.
Exemples : en collection en cours de traitement consommé en prêt retiré de la collection manquant
Type de conservation
La méthode physique de stockage ou de conservation d'un échantillon. Vocabulaire contrôlé obligatoire.
Exemples : dry ethanol liquid nitrogen pinned/pointed
Date de préparation
Date de la préparation physique d'un échantillon. Les dates dans ce champ respectent visuellement le format MM/JJ/AAAA. La saisie manuelle des données dans ce champ est validée à l'aide d'un calendrier.
Exemples : 08/01/2022 05/14/2025
Préparé par
Nom de la personne ayant préparé l'échantillon, sélectionné dans la liste déroulante. La personne doit disposer d'un compte utilisateur sur le portail pour pouvoir être enregistrée dans ce champ.
Exemples : Liao, Rosie Johnston, Andrew
Détails de préparation
Notes fournissant davantage de contexte sur la préparation physique et l'état de l'échantillon.
Exemples : tractus gastro-intestinal supérieur et inférieur rein, gauche, entier préparé au borax
Nombre d'éléments
Le nombre d'objets pouvant faire l'objet d'un prêt associés à l'échantillon, c'est-à-dire toutes les pièces de l'échantillon affectées au même identifiant unique materialSampleID (voir ci-dessus).
Exemples : 0 1 100
Taille de l'échantillon
Quantification de l'échantillon au-delà du simple décompte des objets (par ex. poids sec).
Exemples : 200 µL 20 g
Voir le champ samp_size de l'extension GGBN pour les échantillons de matériel (Material Sample Extension).
Lieu de stockage
L'emplacement physique de stockage d'un échantillon au sein de la collection.
Exemples : Congélateur 3 Stockage grand format Cab011 | Tiroir002
Remarques
Notes, commentaires et informations contextuelles supplémentaires propres à un échantillon, qui ne peuvent être saisis dans les autres champs de données existants.
Exemples : échantillonnage de génotype mâchoire gauche consommée pour la recherche avec squelette post-crânien
Paléontologie
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|---|
| Champs relatifs à la paléontologie et au contexte géologique dans le formulaire de l'éditeur d'occurrences |
Intervalle initial et Intervalle final
Les intervalles de temps géologique les plus anciens (géologiquement les plus vieux, c.-à-d. « Intervalle initial ») et les plus récents (géologiquement les plus jeunes, c.-à-d. « Intervalle final ») attribuables à l'horizon stratigraphique dont provient le matériel fossile catalogué. Chaque valeur saisie pour l'« Intervalle initial » doit correspondre à une valeur pour l'« Intervalle final » ; de même, ces valeurs doivent être cohérentes, c'est-à-dire que la valeur de l'« Intervalle initial » doit être identique ou géologiquement plus ancienne que celle de l'« Intervalle final ». Utilisez les valeurs de l'échelle de temps de l'ICS (Commission internationale de stratigraphie) pour optimiser l'interopérabilité des données, sauf indication contraire de votre gestionnaire de portail. Les valeurs correctement saisies alimenteront automatiquement la série hiérarchique des termes Darwin Core correspondants (voir exemples ci-dessous).
Exemple 1 : Early Interval = Eocene et Late Interval = Oligocene
Exemple 2 : Early Interval = Eocene et Late Interval = Eocene
Incorrect (valeur manquante) : Early Interval = Eocene et Late Interval = null/vide
Incorrect (ordre illogique) : Early Interval = Oligocene et Late Interval = Eocene
Pour Early Interval (Intervalle précoce), voir aussi les termes Darwin Core suivants : earliestEonOrLowestEonothem, earliestEraOrLowestErathem, earliestPeriodOrLowestSystem, earliestEpochOrLowestSeries et earliestAgeOrLowestStage.
Pour Late Interval (Intervalle tardif), voir aussi les termes Darwin Core suivants : latestEonOrHighestEonothem, latestEraOrHighestErathem, latestPeriodOrHighestSystem, latestEpochOrHighestSeries et latestAgeOrHighestStage.
Late Interval
Voir ci-dessus pour Early Interval et Late Interval. ### Âge absolu
L'âge chiffré (en années) du matériel fossile catalogué, déterminé à l'aide de techniques de datation absolue telles que la datation au radiocarbone (carbone 14), K-Ar, U-Pb, Ar-Ar, etc.
Exemples : 20 Ma 75 ka 10,5 – 12,7 +/- 0,5 Ma
Étage local
Nom d'un intervalle de temps géologique utilisé à l'échelle locale ou régionale, mais pas nécessairement reconnu au niveau international (par exemple, un âge basé sur les mammifères terrestres nord-américains).
Exemples : Barstovien Povolzhien Ulatsien Helvétien
Biote
Nom attribué à divers ensembles de fossiles datant du même intervalle de temps géologique que le matériel fossile catalogué, provenant généralement d'une ou plusieurs localités situées dans une zone géographique spécifique.
Exemples : Chalk Bluffs Stewart Valley Bridge Creek Mazon Creek
Biostratigraphie
Le nom de l'unité biostratigraphique dont provient le matériel fossile catalogué.
Exemples : Wa0 Zone à Uvigerinella sparsicostata Ogygiocaris
Voir les termes Darwin Core lowestBiostratigraphicZone et highestBiostratigraphicZone
Environnement du taxon
L'environnement de dépôt de l'unité rocheuse dont provient le matériel fossile catalogué. Un vocabulaire contrôlé est imposé.
Exemples : marin non marin marin et non marin
Groupe
Le nom du groupe lithostratigraphique dont provient le matériel fossile catalogué. Les fournisseurs de données peuvent consulter l'outil de recherche Geolex de la National Geologic Map Database pour normaliser les valeurs selon les noms lithostratigraphiques reconnus par l'US Geological Survey.
Exemples : Bathurst Lower Wealden Monte Cristo Contra Costa Panoche
Voir le terme Darwin Core group
Formation
Le nom de la formation lithostratigraphique dont provient le matériel fossile catalogué. Les fournisseurs de données peuvent consulter l'outil de recherche Geolex de la National Geologic Map Database pour normaliser les valeurs selon les noms lithostratigraphiques reconnus par l'US Geological Survey.
Exemples : Notch Peak House Limestone Fillmore Chinle
Voir le terme Darwin Core formation
Membre
Le nom du membre lithostratigraphique dont provient le matériel fossile catalogué. Les fournisseurs de données peuvent consulter l'outil de recherche Geolex de la National Geologic Map Database pour normaliser les valeurs selon les noms lithostratigraphiques reconnus par l'US Geological Survey.
Exemples : Lava Dam Hellnmaria Brown Mountain Sandstone
Voir le terme member du Darwin Core
Bed (Couche)
Le nom de la couche lithostratigraphique dont provient le matériel fossile catalogué. Les fournisseurs de données peuvent consulter l'outil de recherche Geolex de la National Geologic Map Database pour normaliser les valeurs selon les noms lithostratigraphiques reconnus par l'US Geological Survey.
Exemple : Harlem coal
Voir le terme bed du Darwin Core
Lithology (Lithologie)
Les types de roches ou de sédiments dont provient le matériel fossile catalogué.
Exemples : sandstone mudstone siltstone shale
Remarques stratigraphiques
Détails supplémentaires concernant le contexte géologique et/ou stratigraphique du matériel fossile catalogué qui ne peuvent être saisis dans d'autres champs, tels que des informations plus précises sur le lieu de collecte du spécimen par rapport à une coupe stratigraphique mesurée, le contexte d'un échantillonnage palynologique, des données de carottage, etc.
Exemples : Fossile récolté à environ 1,5 m de la base de la coupe stratigraphique décrite initialement par Alderson (1981). Spécimen récolté à 150 pieds sous le sommet de l'unité.
Élément
Élément(s) anatomique(s) représenté(s) par le matériel fossile catalogué. Il est recommandé d'utiliser un vocabulaire contrôlé spécifique à la discipline et de séparer les valeurs distinctes par une barre verticale (|). Les descriptions anatomiques plus détaillées doivent être saisies dans Description.
Exemples (invertébrés) : pygidium/pygidia thorax
Exemples (vertébrés) : crâne : dentaire crâne : maxillaire vertèbre : corps vertébral
Exemples (paléobotanique) : tige strobile racine pinnule(s)
Exemples (ichnofossiles) : piste de vertébré
Propriétés de la lame
Informations sur les lames préparées à partir du matériel fossile catalogué, précisant des détails tels que le type de préparation et le milieu de montage. Les coordonnées « England Finder » peuvent être consignées dans ce champ, par exemple pour les lames de palynomorphes.
Exemples : répartition aléatoire (strewn) lame mince pétrographique pellicule montée (peel)
ID du contexte géologique
Identifiant de l'ensemble des informations associées au contexte géologique (GeologicalContext) du matériel fossile catalogué, par ex. Groupe, Formation, Membre, Couche, Intervalle (Inférieur/Supérieur). Idéalement, il doit s'agir d'un identifiant unique à l'échelle mondiale ou d'un identifiant spécifique au jeu de données.
Exemple : https://opencontext.org/subjects/e54377f7-4452-4315-b676-40679b10c4d9 https://macrostrat.org/sift/#/strat_name_concept/8320
Voir le terme geologicalContextID du Darwin Core.